L’antibiorésistance à l’hôpital, des inquiétudes fondées

L’antibiorésistance est un phénomène préoccupant contre lequel l’OMS a décidé de se mobiliser. En effet, la mauvaise utilisation de ces médicaments, surconsommation et surtout le mauvais usage, cause la mort de 700 000 personnes dans le monde chaque année dont 33 000 en Europe. La bactérie Klebsiella pneumoniae est un exemple de cette antibiorésistance inquiétante. Cette bactérie est commensale, c’est-à-dire qu’elle ne présente aucun danger lorsqu’elle se trouve dans son milieu naturel : le tube digestif et les voies aériennes de l’homme. Cependant, lorsque K. pneumoniae change de milieu et si la personne est hospitalisée donc fragilisée ou immunodéprimée, cette bactérie devient dangereuse voire mortelle. En parlant d’hôpital, une étude récente publiée dans le British Medical Journal concernant ladite bactérie a souligné que les hôpitaux constitueraient l’endroit où la transmission est la plus conséquente. Fait inquiétant lorsque l’on sait que cette bactérie a été responsable de 2094 morts en Europe en 2015, contre 341 en 2007.

Quand les bactéries prennent le pouvoir

Jusqu’en 2014, les patients étaient traités avec un antibiotique de dernière génération, les céphalosporines. Puis les scientifiques ont remarqué que K. pneumoniae résistait aux céphalosporines et ont donc administré des carbapénèmes, antibiotiques de dernier recours. Mais cette étude, menée sur 1700 échantillons de bactéries prélevés sur des patients de 244 hôpitaux dans 32 pays européens, souligne qu’une fois encore, K. pneumoniae résiste. Elle produit en effet des carbapénémases, des enzymes capables de résister à ces antibiotiques de derniers recours, les carbapénèmes. L’antibiorésistance a de quoi inquiéter les organismes de santé, d’autant plus que plus de cette bactérie semble se propager entre les patients d’un même hôpital : plus de 50% des prélèvements contenant des carbapénémases étaient particulièrement proches d’autres échantillons prélevés au sein d’un même hôpital. Conclusion ? Les bactéries se propageraient au sein d’un même hôpital…

Une autre bactérie qui donne du fil à retordre aux hôpitaux :

Les infections à Clostridium difficile, bête noire des hôpitaux

Pendant ce temps là, fabrication d’un antibiotique contre… l’antibiorésistance !

Alors que l’antibiorésistance ne cesse de progresser, cet été, le Pr Brice Felden et son équipe du laboratoire Inserm-Université de Rennes 1 avec une équipe de l’Institut des sciences chimiques de Rennes (ISCR) déclarait avoir potentiellement trouvé un nouvel antibiotique capable de lutter contre les bactéries résistantes et surtout qui ne déclenche pas de résistance.

« Tout est parti d’une découverte fondamentale en 2011, explique Brice Felden, nous nous sommes rendu compte qu’une toxine fabriquée par les staphylocoques dorés dont le rôle était de faciliter l’infection était également capable de tuer d’autres bactéries présentes dans notre organisme. Nous avions ainsi identifié une molécule qui possédait une double activité toxique et antibiotique. Nous nous sommes dit que si nous arrivions à dissocier ces 2 activités, nous serions capables de créer un nouvel antibiotique dépourvu de toxicité sur notre organisme. Restait à relever ce challenge ».

Les peptidomométiques…

Les chercheurs ont ainsi créé une nouvelle famille de peptides bactériens synthétiques, appelés peptidomométiques. Parmi eux, deux peptides se sont révélés efficaces contre le staphylocoque doré et les pseudomonas aeruginosa résistants. Ces deux peptides montrent une très bonne tolérance mais aussi aucune toxicité sur les cellules humaines et animales testées. « Nous les avons testés à des doses 10 à 50 fois supérieures à la dose efficace sans observer de toxicité », précise Brice Felden. Et le professeur Felden de conclure : « Nous pensons que ces nouvelles molécules représentent des candidats prometteurs au développement de nouveaux antibiotiques, pouvant apporter des traitements alternatifs à la résistance aux antimicrobiens ». Une aventure à suivre car les essais cliniques de phase 1 chez l’homme n’ont pas encore commencé… Mais un antibiotique pour lutter contre l’antibiorésistance, n’est-ce pas un peu le serpent qui se mord la queue ?

La phagothérapie vous dit quelque chose ? Et l’utilisation de virus contre les bactéries résistantes ?

Les phages attaquent

Sources

– British Medical Journal,
– Inserm,
– Le Figaro Santé,
– La Nutrition.

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Antibiorésistance

Depuis la découverte de Flemming en 1928, l’usage des antibiotiques s’est largement répandu. Santé humaine, santé vétérinaire, élevage, leurs applications sont multiples et parfois détournées de leur objectif primaire qui est de soigner humains et animaux des infections bactériennes. Aujourd’hui, cet usage répandu et non contrôlé favorise l’apparition de résistance dans certaines familles bactériennes. Au point que les antibiotiques ne sont de plus aucun recours face à certaines bactéries.

Des pistes encourageantes pour lutter contre l’antibiorésistance

Pour lutter contre l’antibiorésistance, la politique mise en place vise à raisonner l’usage des antibiotiques : usage non systématique, respect des indications et des posologies, … Le grand public, comme les professionnels de santé, a un rôle à jouer dans cette démarche.
En parallèle, des solutions de substitution émergent dans les milieux de la recherche :
– La greffe de microbiote fécal, notamment pour les infections récidivantes à la bactérie Clostridium difficile,

Les infections à Clostridium difficile, bête noire des hôpitaux

– La phagothérapie, qui utilise des virus qui s’attaquent aux bactéries,
– La mise au point de nouvelles classes d’antibiotiques…

Et le cannabis et antibiorésistance dans tout ça ?

Aussi inattendu que cela puisse paraître, le cannabis pourrait bien constituer une nouvelle piste de lutte contre l’antibiorésistance ! Ou plus exactement le cannabidiol (aussi connu sous le sigle CBD) : le cannabis (ou chanvre) contient de nombreuses molécules de la famille des cannabinoïdes parmi lesquels le delta-9-tétrahydrocannabinol (alias le THC) et le cannabidiol (alias le CBD). Tous sont des composés actifs, ce dernier n’ayant cependant pas de propriétés stupéfiantes.

Lors du dernier congrès de l’American Society for Microbiology, des chercheurs australiens ont présenté des données prometteuses sur le cannabidiol. Au cours d’études en laboratoire, ils ont montré que le cannabidiol avait des propriétés antibiotiques et était ainsi capable de tuer des bactéries. Cette activité a notamment été observée sur des bactéries responsables d’infections telles que Staphyloccocus aureus et Streptococcus pneumoniae, ainsi que sur des bactéries ayant déjà montré des signes de résistance vis-à-vis d’antibiotiques courants.
Couplée aux propriétés anti-inflammatoires du cannabidiol, cette nouvelle propriété s’avère donc particulièrement intéressante selon les chercheurs, qui veulent continuer à explorer la molécule.

Mais que les choses soient bien claires entre nous, il n’est pas (encore!) question ici de fumer de manière illicite pour traiter une infection !

Antibiorésistance : quand les bactéries font de la résistance

Sources

– ANSM,
– OMS,
–  Mission interministérielle de lutte contre les drogues et les conduites addictives (MILDECA),
– Le Monde.

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La canneberge et ses bienfaits connus depuis des millénaires

Ces petites baies rouges font fureur depuis quelques années. Leurs vertus médicinales et leur bienfaits antibactériens ne sont plus à démontrer. Plus connue sous le nom de cranberry, ce petit fruit acidulé cousin de la myrtille et du bleuet, a longtemps été considéré comme un don du ciel par les Indiens d’Amérique. Elle leur servait notamment à soigner les blessures, sous forme de cataplasme. Dons ses bienfaits sont reconnus depuis des lustres !

D’où proviennent ses vertus ?

Les canneberges sont riches en polyphénols et notamment en proanthocyanidines, des anti-oxydants très puissants. Ce sont ces antioxydants qui lui procurent ses bienfaits et notamment la capacité de la canneberge à empêcher les bactéries d’adhérer aux parois de la vessie, sur les dents ou les gencives. La canneberge est notamment utilisée en cas d’infection urinaire.

Canneberge : un nouveau bienfait découvert ?

La résistance aux antibiotiques ou antibiorésistance, est l’une des plus grandes menaces qui pèse sur la santé humaine. Lorsque nous mettons en contact une bactérie avec un antibiotique, à force, celle-ci développe bien souvent une résistance aux antibiotiques. Il nous faut donc trouver de nouvelles molécules qui permettraient de lutter contre les infections bactériennes sans pour autant générer d’antibiorésistance sur le long terme.

Antibiorésistance : quand les bactéries font de la résistance

Canneberge et antibiorésistance ?

Les chercheurs ont pensé que la canneberge pourrait renforcer l’efficacité des antibiotiques. Une étude a donc été lancée pour valider ou non ce postulat. Ils ont donc mis au contact de bactéries différentes molécules extraites des canneberges. Cette mise en contact a été également associée à l’exposition à un traitement antibiotique. Résultat, certaines bactéries deviennent plus sensibles au traitement antibiotique si on y associe des extraits de canneberge.

Cette efficacité accrue semble provenir des polyphénols et particulièrement des proanthocyanidines. Les proanthocyanidines rendraient les bactéries plus sensibles aux antibiotiques en facilitant le passage de l’antibiotique à l’intérieur même de la bactérie. De plus, ces puissants antioxydants inhiberaient aussi les mécanismes qui évacuent les antibiotiques à l’extérieur des bactéries. Ainsi les antibiotiques se retrouvent piégés à l’intérieur même de la bactérie.

Les premiers essais sur les insectes semblent être concluants et aller dans le sens d’une baisse de l’antibiorésistance lorsque l’on expose la bactérie aux canneberges, en même temps que le traitement antibiotique. Cependant, avant de valider définitivement ce travail, les chercheurs devront aussi identifier les synergies possibles entre les différentes proanthocyanidines et vérifier l’innocuité et l’efficacité in vitro et in vivo, des extraits de canneberges. Un nouvel espoir donc pour réduire les doses d’antibiotiques nécessaires dans la médecine humaine afin de combattre la résistance aux antibiotiques.

Les antibiotiques c’est la panique !

Sources

– Vimal B. Maisuria, Mira Okshevsky, Eric Déziel, Nathalie Tufenkji, « Proanthocyanidin Interferes with Intrinsic Antibiotic Resistance Mechanisms of Gram-Negative Bacteria ? », Advanced Science, 28 mai 2019,
– Santé sur le Net, Résistance aux antibiotiques : un allié nommé canneberge ?
– ConsomGlobe, Le cranberry : le fruit santé,

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Clostridium difficile, la bactérie qui ne vous veut pas du bien

C. difficile est une bactérie pathogène qui peut être responsable de diarrhées plus ou moins graves. Elle est souvent présente dans nos intestins, sous une forme dormante appelée « spore ». Elle est alors inactive et inoffensive… jusqu’au moment où elle se « réveille » et reprend une forme active, sous l’effet d’une stimulation ou d’une modification de l’environnement.
Les traitements par antibiotiques et une alimentation pauvre en fibres sont par exemple incriminés dans les cas d’infection à C. difficile. Et quel est leur point commun ? Celui de perturber la flore intestinale…

Tout savoir sur le microbiote intestinal

Quand C. difficile prend ses quartiers dans notre intestin

Une flore intestinale perturbée, un déséquilibre qui apparaît, et voilà notre C. difficile qui peut s’installer tranquillement et faire ses ravages dans nos intestins.
Pour rentrer dans les détails, le mécanisme inclut les sels biliaires, des molécules synthétisées par notre vésicule biliaire sous une forme « primaire » et qui participent à l’absorption des lipides alimentaires. Au contact de nos bactéries intestinales, ces sels biliaires sont transformés en acides biliaires secondaires, qui s’opposent à la multiplication et la colonisation de notre muqueuse intestinale par C. difficile. Si notre flore intestinale est perturbée, la transformation des acides biliaires primaires en acides biliaires secondaires n’est plus assurée correctement, la protection n’est plus suffisante et C. difficile s’installe tranquillement.

L’antibiothérapie, cause… et conséquence

Cela peut paraître contradictoire, mais la première prise en charge d’une infection à C. difficile est l’antibiothérapie ! Bien sûr il s’agira d’une antibiothérapie différente que celle qui a pu initier l’infection puisqu’elle sera ciblée contre la bactérie pathogène.

Tout se passerait bien si on s’arrêtait là. Sauf que dans 20% des cas, une récidive est observée : l’éradication n’a pas été suffisante, des spores sont toujours présentes dans l’intestin, ou la bactérie a développé une antiobiorésistance. Et les récidives peuvent malheureusement s’enchaîner.

Microbiote et antibiorésistance : la mauvaise collaboration

Une étude récente réalisée sur un modèle animal a montré qu’une alimentation pauvre en fibres alimentaires favorisait la récidive. Ce qui amène l’équipe de chercheurs à formuler l’hypothèse d’un effet bénéfique associé à une alimentation riche en fibres chez les personnes à risque de récidive.

La greffe fécale, solution de la dernière chance

La dernière alternative pour les patients touchés par ces infections récidivantes à C. difficile réside dans la greffe fécale. Ces infections sont d’ailleurs à ce jour la seule indication justifiant le recours à cette prise en charge. La greffe fécale ou transplantation du microbiote fécal (TMF) consiste à remplacer le microbiote intestinal du patient par le microbiote d’une personne considérée comme saine. Pour ces patients souffrant d’infections récidivantes à C. difficile, il s’agit un peu du traitement de la dernière chance mais la libération est quasi assurée : 85 à 90% des patients sont guéris après une transplantation fécale et le taux de succès est de 100% après deux transplantations !

Rectocolite hémorragique et greffe fécale : des espoirs permis ?

Sources

– Médecines/Sciences,
– Revue médicale suisse,
– Association FMC-HGE,
– Kyne L, Kelly CP., « Recurrent Clostridium difficile diarrhoea. », Gut, juillet 2001, 49(1), p. 152-3,
– Gut Microbiota for Health.

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Helicobacter pylori, bactérie inflammatoire

Helicobacter pylori est une bactérie relativement commune dans nos estomacs, puisque 15 à 30% des adultes en seraient porteurs. Dans les faits, cette colonisation peut passer relativement inaperçue. Pourtant au contact de la paroi de l’estomac, H. pylori entraîne une inflammation chronique : la gastrite. Celle-ci peut provoquer quelques troubles digestifs tels que gêne et douleurs, sans plus. Mais selon le terrain de la personne, cette inflammation peut évoluer vers un ulcère gastro-duodénal voire un cancer gastrique, respectivement 10% et 1% des personnes infectées par H. pylori seraient touchées.

La chasse à Helicobacter pylori est lancée

En présence de symptômes ou d’antécédents personnels ou familiaux, le médecin généraliste ou le gastro-entérologue peut prescrire des examens pour rechercher une infection à H. pylori. Deux approches sont possibles :
– La fibroscopie digestive, ou endoscopie digestive, qui permet notamment de prélever un échantillon de la paroi gastrique pour y rechercher la présence d’H. pylori

Tout savoir sur l’endoscopie digestive haute

– La prise de sang, qui vise à rechercher des anticorps (des composants du système immunitaire) dirigés contre la bactérie. En cas de résultat positif, une fibroscopie est réalisée pour confirmer le diagnostic.

Le traitement est ensuite relativement simple : face à une infection bactérienne, seuls les antibiotiques peuvent apporter la solution. En complément, un médicament anti-acide est prescrit pour réduire l’acidité de l’estomac pendant la durée du traitement.

Le patient, acteur clé du traitement contre Helicobacter pylori

Actuellement, le traitement permet d’éliminer H. pylori, et donc l’infection associée, dans 80 à 90% des cas. Un examen de contrôle (généralement un test respiratoire à l’urée) permet de confirmer l’éradication de la bactérie. Aucun suivi particulier n’est ensuite nécessaire en raison du très faible risque de ré-infection.
A contrario, le traitement s’avère inefficace dans 10 à 20% des cas. Les échecs de traitement s’expliquent par deux causes principales : soit la bactérie est résistante à l’antibiotique prescrit et alors celui-ci n’a aucun effet sur H. pylori, soit le patient n’a pas correctement respecté le traitement prescrit et il existe un risque que la bactérie développe une résistance à l’antibiotique prescrit. Dans les 2 cas, le traitement est renouvelé mais avec un nouvel antibiotique.

Antibiorésistance : quand les bactéries font de la résistance

Même sans signes d’ulcère ou de cancer, une infection à H. pylori doit être traitée afin de réduire les risques de complications et améliorer les troubles digestifs liés à l’inflammation.

Sources

– Haute Autorité de Santé, « La recherche et le traitement de Helicobacter pylori »,
– Le Webzine de la Haute Autorité de Santé, 20 mars 2019,
– Haute Autorité de Santé, fiche patient, « La recherche de Helicobacter pylori »,
– Haute Autorité de Santé, fiche patient « Le traitement de Helicobacter pylori ».

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La lutte contre l’antibiorésistance s’organise !

Face à cette émergence de l’antibiorésistance, plusieurs approches sont possibles :
– Raisonner l’usage des antibiotiques ;
– Trouver des solutions de substitutions : nouveaux antibiotiques, phages… ;
– Comprendre les mécanismes de résistance des bactéries pour les contourner.

Les phages attaquent

C’est sur ce dernier point que des chercheurs de l’Université d’Hamilton au Canada ont orienté leurs investigations.

Quand les antibiotiques attaquent, les bactéries contre-attaquent

Ils se sont intéressés à une classe d’antibiotiques en particulier, les polymyxines, qui sont des molécules efficaces même dans certaines situations d’infections causées par des bactéries multi-résistantes. Il s’agit donc d’antibiotiques utilisés en dernier recours de traitement.

Or, des cas de résistance aux polymyxines commencent à émerger, remettant en cause notre capacité à traiter ces mêmes infections.

Antibiorésistance : quand les bactéries font de la résistance

Les scientifiques ont donc cherché à comprendre quels changements ayant lieu dans les bactéries entraînaient l’apparition de cette antibiorésistance.

La résistance des bactéries face aux antibiotiques élucidée

En travaillant dans des conditions in vitro, les chercheurs ont réussi à identifier les facteurs responsables de l’antibiorésistance.

Il était connu que cette molécule exerce son activité antibiotique en se fixant sur la paroi des bactéries et en y créant des pores. Ces micro-trous déstabilisent l’intégrité de la bactérie ce qui entraîne sa destruction.

Deux mécanismes différents pourraient alors expliquer la résistance à l’antibiotique :
– Une diminution de la charge électrique présente naturellement à la surface de la bactérie. L’attraction de la molécule antibiotique est alors réduite.
– Un épaississement de la membrane bactérienne, qui rend sa perforation plus difficile.

Ainsi, en étudiant la capacité des bactéries à faire évoluer leur charge électrique et l’épaisseur de leur membrane, il serait possible de prédire les capacités de résistance des bactéries ciblées par les polymyxines.

Sources

– Khondker A, Dhaliwal AK, SaemS, Mahmood A, Fradin C, Moran-Mirabal J, Rheinstädter MC.  « Membrane charge and lipid packing determine polymyxin-induced membrane damage. », Communications Biology,  2019, 2(67),
– The Lancet,
– Ministère des Solidarités et de la Santé,
– Pourquoi Docteur.

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Du petit pipi innocent à la pollution de l’environnement…

Saviez-vous qu’en 2009, des scientifiques remarquaient que le nombre de poissons d’eau douce féminins était en nette augmentation à cause des œstrogènes ? Petite explication : les œstrogènes sont des hormones qui se trouvent dans la pilule et que l’on retrouve donc dans les urines des femmes qui la prennent. Cette urine se retrouve dans les eaux usées, traitées dans les stations d’épuration. Si ces stations parviennent à traiter ces eaux, elles ne peuvent en extraire les hormones qui s’y trouvent. En déversant ensuite les eaux traitées avec les hormones, les poissons sont ainsi contaminés.

Il en va de même pour l’antibiorésistance. Quel rapport ?

Lorsque vous prenez un antibiotique vous encouragez les bactéries à en créer d’autres qui sont antibiorésistantes, et que nous retrouvons en grande quantité dans le microbiote. Vous savez bien que le microbiote c’est notre caca ! Et où le retrouve-t-on après notre passage aux toilettes ? Dans les eaux usées qui vont-elles-mêmes dans les stations d’épuration. Les eaux traitées sont ensuite déversées dans la nature. C’est ainsi que dans la revue Nature Communication, le 8 janvier 2019, des scientifiques ont montré qu’à la sortie des stations d’épuration « la quantité des bactéries antiobiorésistantes est étroitement corrélée à la présence du  crAssphage , un bactériophage uniquement présent dans les excréments d’origine humaine et qui ne semble pas se développer hors des intestins. » Ces bactéries sont donc produites par l’homme. 

Microbiote et antibiorésistance : la mauvaise collaboration

Mais ce n’est pas tout !

Si 70 % des gènes de résistance sont détruits dans la station d’épuration, on en retrouve 30 % dans les eaux traitées. Ce phénomène s’expliquerait de deux façons. Tout d’abord, les conditions de vie dans les stations d’épuration. Il existe une corrélation entre la fréquence de l’antibiorésistance et la concentration de certains antibiotiques. 

Mais aussi la promiscuité entre les micro-organismes.  Les chercheurs ont vérifié s’il pouvait exister un échange de matériel génétique entre bactéries. Ce que l’on prouve par la présence de gènes marqueurs. Résutat : « ces gènes marqueurs se trouvaient souvent à proximité immédiate de gènes de résistance et leur présence indique donc que des échanges conséquents de gènes de résistance s’effectuent entre les germes pathogènes venant des êtres humains et les autres bactéries. »

Bon, d’accord mais quelles sont les conséquences de tout ça ? D’après les chercheurs, le scénario est en cascades. « Si des gènes de résistance sont transmis aux bactéries des boues activées et si ces dernières se disséminent dans l’environnement, elles y ont probablement de meilleures chances de survie que les germes pathogènes.». Ces bactéries sont ingérées par des êtres vivants qui ensuite seront ingérées par l’homme et qui ainsi développera une antibiorésistance. Et c’est pourquoi l’Organisation mondiale de la santé déclare : « Nous risquons aujourd’hui une ère postantibiotique dans laquelle des infections courantes et de petites blessures seront à nouveau mortelles. »

La seule solution pour éviter tout cela est de revoir le fonctionnement des stations d’épuration. Les Suisses sont en bonne voie. « (…) le meilleur moyen de l’éviter est d’extraire totalement la biomasse de l’eau dans les STEP. Les nouvelles techniques progressivement mises en œuvre dans les stations d’épuration suisses pour éliminer les micropolluants y contribueront. »

Ah, la légendaire propreté suisse…

Au cœur du caca

Sources

– Nature Communication,
– Futura Sciences,
– Futura Sciences,
– Conseil fédéral suisse,

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Microbiote et antibiorésistance : quand les bactéries se rebellent

Lorsque notre organisme est attaqué par une bactérie, c’est notre système immunitaire qui se charge de nous en débarrasser. Cependant, notre microbiote intestinal est composé majoritairement de bactéries. Notre système immunitaire qui est chargé de lutter contre les bactéries semble donc accepter les bactéries du microbiote et en même temps reconnaître et éradiquer celles qui sont pathogènes. Il existe donc bien une relation entre bactéries et organisme-hôte qui permet la survie des deux.

Virus versus bactéries

Philippe Glaser nous rappelle qu’il y a une différence entre les virus et les bactéries. Un virus est responsable d’une infection, on s’en débarrasse avec un antivirus. Les bactéries sont présentes partout sur notre corps, nous en avons dans la bouche dans l’intestin… Prendre un traitement d’antibiotiques contre une infection ne supprime pas une infection, « les antibiotiques n’auront pas d’effet sur l’infection mais vont avoir un effet collatéral et s’attaquer également à la flore intestinale. ». Et second effet, en s’attaquant à des bactéries moins résistantes, les antibiotiques favorisent la prolifération de bactéries plus résistantes qui sont « difficiles à traiter et qui demandent des traitements plus longs avec plus d’effets indésirables et une mortalité augmentée. »

Défense du microbiote

Le microbiote, ou plus exactement les bactéries qui le composent, ont deux mécanismes de défense. Tout d’abord, elles profitent d’une mutation de leurs gènes qui leur donne la possibilité de résister à un agent comme l’antibiotique.

En effet, les bactéries qui composent notre microbiote ont un rythme de multiplication élevé. Lorsqu’une cellule bactérienne est placée dans un milieu de culture convenable, elle augmente de taille puis se divise en deux cellules. Ces deux cellules font de même, et les quatre cellules également. « Les bactéries ont (…) un rythme de multiplication si élevé, pouvant à chaque génération provoquer des mutations aléatoires, que les chances que quelques-unes d’entre elles acquièrent par accident la capacité de résister à un antibiotique est mécaniquement élevé. ».

Lorsque nous prenons un antibiotique chaque cellule en se divisant peut en créer une autre qui peut bénéficier d’une mutation qui la prévaut contre l’action d’un antibiotique. « Notre flore peut, comme les autres bactéries, acquérir une résistance. Excrétées par les selles, les bactéries de notre flore se retrouvent ensuite au contact d’autres types de bactéries, potentiellement dangereuses… Auprès desquelles elles pourront disséminer cette résistance. »

Deuxième possibilité, les bactéries intestinales utilisent les compétences d’une autre bactérie pour se protéger d’un antibiotique. « Ainsi, une bactérie sensible à un antibiotique pourra acquérir le gène de résistance auprès d’une de ses congénères déjà résistante. ». C’est ce que les biologistes appellent le mutualisme, c’est-à-dire « une interaction entre 2 espèces qui vont tirer toutes deux 2 profit de cette relation. »

Antibiorésistance : quand les bactéries font de la résistance

Le mutualisme, un fait de laboratoire

Pour l’instant, le mutualisme n’a été exploité qu’en laboratoire par une équipe de chercheurs britanniques. Mais cette relation montre bien l’interdépendance qui existe entre l’hôte et les bactéries. L’hôte, c’est-à-dire notre organisme, et la bactérie ne peuvent survivre l’un sans l’autre. « L’hôte bénéficie de la protection de certaines bactéries et les bactéries bénéficient avec l’hôte d’un environnement de vie propice à leur survie. ». C’est ainsi que s’opère un échange de bons procédés. « Les microbes peuvent travailler avec leur hôte pour empêcher l’infection. ».

Les chercheurs britanniques vérifient cette idée sur un ver à qui ils ont implanté une bactérie intestinale « susceptible de le protéger contre une infection bactérienne plus pathogène. ». Les observations montrent qu’après quelques semaines d’évolution, le ver et la bactérie ont « forgé une alliance mutuellement bénéfique qui les protège notamment tous deux des attaques des parasites. ».

Une protection mutuelle

La protection de l’hôte par le microbe et inversement n’est pas un fait nouveau, les chercheurs le connaissent déjà. Cependant, cette étude montre un fait plus nouveau, chacun évolue pour permettre à l’autre de survivre. Ainsi, « Les bactéries ont évolué pour devenir plus protectrices, et à leur tour, les hôtes ont évolué pour autoriser une colonisation plus importante par la bactérie E. faecalis. »

Cette évolution qui se fait en fonction de l’autre ne doit être ni trop agressive ni trop faible, « si la protection est trop faible, il y a peu d’avantages pour l’hôte à héberger la bactérie, mais si la protection est trop élevée, d’autres microbes peuvent être éliminés, ce qui élimine le besoin de protection. »

Certains médicaments en cause dans l’altération du microbiote ?

Sources

– INRA, « Colloque interministériel antibiorésistance : enjeux et besoins en recherche et innovation »,
– Charlotte Rafaluk‐Mohr et al., « Mutual fitness benefits arise during coevolution in a nematode‐defensive microbe model », Evolution Letters, mai 2018,
– Sciences et Avenir,
– Santé Log.

Toutes les citations concernant l’antibiorésistance du microbiote sont celles de Philippe Glaser, directeur de recherche de l’unité « Ecologie et Evolution de la Résistance aux Antibiotiques » à l’Institut Pasteur pour Sciences et Avenir. Quant à celles sur le mutualisme, vous les retrouverez sur le site Santé Log.

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L’ère des antibiotiques

Un antibiotique est une « substance, d’origine naturelle ou synthétique, utilisée contre les infections causées par les bactéries ». Les infections liées aux bactéries, là est le problème. En effet, les maladies infectieuses se multiplient au XIXe siècle pour devenir la première cause de mortalité. Les immunologistes, les microbiologistes et les parasitologues concentrent leurs recherches sur la possibilité de détruire ces bactéries. Et le miracle vint grâce à la pénicilline et Alexander Fleming (sans oublier Ernest Duchesne tombé dans l’oubli, Howard Florey, Ernst Chain et Norman Heatley). Les maladies infectieuses commencèrent alors à diminuer pour qu’ensuite la population n’ait plus peur des infections.

Fleming reçut d’ailleurs le prix Nobel de Médecine en 1945 et, lors de son discours, prononça une phrase prémonitoire : « La pénicilline est non toxique quelles qu’en soient ses indications et il n’y a pas d’inquiétude à en prendre des doses importantes. Néanmoins, il y a peut-être un danger au sous-dosage. Il n’est pas difficile de rendre les microbes résistants à la pénicilline au laboratoire en les exposant à des concentrations trop faibles pour les tuer, et le même phénomène pourrait survenir dans notre organisme ». Fleming avait raison, les bactéries résistent aux antibiotiques. En 2001, la communauté scientifique constate que le pneumocoque résiste désormais à la pénicilline. La sélection naturelle classique a fait le reste : quand 1% d’une souche résiste au blocage de sa reproduction par un antibiotique, c’est ce faible pourcentage de la souche qui se reproduit pour à terme représenter 99% de la population.

Antibiotiques et bactéries, un duel au sommet

Les bactéries qui résistent aux antibiotiques ont toujours existé, qu’il s’agisse d’une résistance naturelle, dressant le profil de l’antibiotique, ou de résistance acquise, permettant à la bactérie de survivre si elle croise un antibiotique. Aujourd’hui, c’est l’accumulation de résistances acquises qui pose problème, permettant de fait aux bactéries de résister aux antibiotiques. C’est l’antibiorésistance. Les conséquences ? L’appauvrissement du choix thérapeutique et le risque d’échec d’un traitement.

Pour comprendre l’antibiorésistance :

Antibiorésistance : quand les bactéries font de la résistance

Les antibiotiques c’est la panique !

Dans son ouvrage, le Docteur Ruppé part d’un exemple qu’il a vécu : celui de Lucie, fraîchement rentrée d’Inde, en proie à une infection urinaire. Étant habituée à ladite infection, elle consomme son antibiotique habituel. Le lendemain cependant, nulle amélioration constatée. Pire encore, ses symptômes ont empiré : vessie très douloureuse, fatigue extrême, vertiges puis malaise. Une fois transportée à l’hôpital, l’équipe lui administre deux antibiotiques, estimant qu’elle ira mieux dès le lendemain. Or le lendemain, l’état de Lucie ne s’améliore pas, l’équipe médicale décide alors d’utiliser un autre antibiotique, actif sur un plus grand nombre de bactéries. Mais l’état de la patiente continue d’empirer. Le laboratoire bactériologique finit par comprendre que la bactérie qui ronge Lucie, Escherichia coli, a résisté à tous les antibiotiques testés ! Tous sauf un, la colistine, qui parvient à détruire cette bactérie. Seulement, l’unique antibiotique permettant d’annihiler l’antibiorésistance des bactéries est particulièrement toxique pour le foie. Un usage de dernier recours lié à sa toxicité mais dont la consommation ne cesse de croître. Les antibiotiques, c’est vraiment la panique !

Les antibiotiques sont précieux, utilisons-les mieux

La France est le quatrième pays qui consomme le plus d’antibiotiques à l’échelle européenne. Au moindre bobo, un antibio ! Vous comprenez donc aisémént le dessein du slogan de l’Assurance maladie « les antibiotiques, c’est pas automatique » : faire diminuer la consommation d’antibiotiques. Ce slogan, qui date de 2002, a fait fureur : entre 2003 et 2007 la consommation d’antibiotiques a diminué de 26,5% par rapport à la période 2000-2002. L’assurance maladie revient en 2018 avec un nouveau slogan « les antibiotiques sont précieux, utilisons-les mieux ». En effet, nombreux sont ceux qui se ruent dans leur trousse à pharmacie dès qu’ils se sentent un peu moins en forme.

Un cas particulièrement intéressant, l’angine, révèle l’absurdité de cette surconsommation d’antibiotiques. Vous faites peut-être partie des gens qui ont ingéré des antibiotiques lors d’une angine ou d’un rhume. Seulement, il convient de distinguer infections bactériennes et infections virales. En effet, si les antibiotiques sont prescrits pour venir à bout des infections bactériennes, ils sont totalement inutiles pour traiter les virus, comme l’angine et le rhume donc. S’il est impensable à ce jour de se passer d’antibiotiques, force est de constater qu’une surconsommation atténue leur efficacité. Aussi, oui aux antibiotiques, mais comme pour le vin, à consommer avec modération et discernement.

10 000 décès par an liés à un mauvais usage des médicaments. Comment y remédier ?

Si vous souhaitez en savoir davantage sur les antibiotiques, l’antibiorésistance et les pistes pour y remédier, LQDP vous recommande chaudement l’ouvrage du Dr Ruppé.

Docteur Étienne Ruppé, Les antibiotiques c’est la panique, Éditions Quæ, 30 août 2018, 18 €. Disponible sur le site de l’éditeur.

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Antibiotiques : première ligne de défense contre les infections bactériennes

A l’origine il y a des bactéries, dont certaines peuvent être nuisibles à l’homme en provoquant des infections : pneumonies, cystites, angine bactérienne, bronchites, méningites, septicémies …

Les antibiotiques sont des médicaments qui ont la capacité de bloquer le développement de ces bactéries, voire de les tuer. Il existe des antibiotiques actifs pour une seule bactérie ou un nombre restreint d’entre elles (ciblés ou à spectre restreint) et ceux qui peuvent agir sur un grand nombre de bactéries (à large spectre).

Attention ! Les antibiotiques ne sont efficaces que sur les bactéries, et n’ont aucun effet sur les virus et les champignons, qui peuvent eux-aussi être à l’origine de maladies.

Trop de médicaments à la maison : la solution est en nous !

On parle d’antibiorésistance lorsque les bactéries, ciblées par les antibiotiques, développent une résistance vis-à-vis de ces derniers. Les bactéries sont des organismes en constante évolution, capables de s’adapter à leur environnement. Au contact répété et prolongé des antibiotiques, elles développent des mécanismes de défense qui leur permettent de résister à ces traitements. Ce phénomène d’antibiorésistance est observé chez les bactéries responsables des infections mais également chez les bactéries naturelles de l’environnement et non pathogènes : les bactéries présentes dans notre organisme, mais également celles présentes chez les animaux (de compagnie, d’élevage) et dans l’environnement au sens large.

Antibiorésistance : pourquoi on pourrait perdre la bataille

Les 4 causes principales

Depuis la découverte de la pénicilline en 1928, l’usage des antibiotiques s’est largement répandu, pour l’usage humain, dans le traitement de maladies, mais également chez les animaux, comme moyen de traitement ou comme facteur de croissance (cet usage est interdit en Europe depuis 2006).

Plusieurs facteurs ont conduit à l’émergence de l’antibiorésistance :
– Un usage excessif et parfois inapproprié
– L’arrêt de production de certains antibiotiques
– La diminution de la recherche dans ce domaine
– La contamination de l’environnement
Chacun de ces cas a favorisé une exposition importante et régulière des bactéries aux mêmes antibiotiques, ce qui les a amenées à développer les mécanismes de défense à l’origine de l’antibiorésistance.

La fin des antibiotiques ?

Du fait du développement de l’antibiorésistance, les antibiotiques existants deviennent inefficaces et perdent leur capacité à nous soigner.
Les médecins, sont alors contraints d’en utiliser des toujours plus puissants, notamment dans les milieux hospitaliers plus exposés aux problèmes d’infections. Or l’usage régulier de ces antibiotiques plus puissants va entraîner à son tour une antibiorésistance…

Certaines souches bactériennes sont déjà multi-résistantes, c’est-à-dire résistantes à plusieurs antibiotiques et depuis une quinzaine d’années, les spécialistes voient émerger des souches hautement résistantes qui sont récalcitrantes à quasiment tous les antibiotiques existants !
Le risque extrême est donc de se retrouver dans des situations où les antibiotiques ne sont plus efficaces pour traiter les infections et où aucune autre alternative thérapeutique n’est disponible. Ceci conduirait à la situation où l’antibiorésistance deviendrait l’une des premières causes mondiales de mortalité.

Perspectives et moyens d’action

Rassurez-vous, il n’est pas pour autant question d’arrêter tout usage des antibiotiques !
Mais l’objectif actuel est de préserver son efficacité  le plus longtemps possible. Pour cela, plusieurs actions sont à portée de main :
Pour les patients :
– Ne pas prendre d’antibiotiques sans prescription médicale justifiée
– Respecter les indications de traitement (posologie, fréquence des prises, durée du traitement, …)
Pour les médecins :
– Les prescrire dans les situations appropriées, en l’occurrence en cas d’infection bactérienne
– Choisir un antibiotique pertinent pour la bactérie ciblée
– Adapter le traitement, notamment la durée, au strict nécessaire
Le milieu scientifique travaille également de son côté pour lutter contre l’antibiorésistance en développant de nouvelles stratégies thérapeutiques, notamment par la recherche de nouveaux antibiotiques et le déploiement de la phagothérapie.

Les phages attaquent

Sources :

Site Ameli, Les antibiotiques sont souvent utilisés à tort https://www.ameli.fr/assure/sante/medicaments/utiliser-medicaments/utiliser-antibiotiques

Site Ameli, Antibiorésistance https://www.ameli.fr/assure/sante/medicaments/antibioresistance/antibioresistance

Site de la Commission Européenne, communiqué de presse « Interdiction des antibiotiques comme facteurs de croissance dans les aliments pour animaux », décembre 2005 http://europa.eu/rapid/press-release_IP-05-1687_fr.htm?locale=FR

Site Inserm, Résistance aux antibiotiques https://www.inserm.fr/information-en-sante/dossiers-information/resistance-antibiotiques

Site de l’Institut Pasteur, Résistance aux antibiotiques https://www.pasteur.fr/fr/centre-medical/fiches-maladies/resistance-aux-antibiotiques

Site du Ministère des Solidarités et de la Santé, L’antibiorésistance : pourquoi est-ce si grave ?  https://solidarites-sante.gouv.fr/prevention-en-sante/les-antibiotiques-des-medicaments-essentiels-a-preserver/des-antibiotiques-a-l-antibioresistance/article/l-antibioresistance-pourquoi-est-ce-si-grave

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